水性漆烤漆房与普通烤漆房在多个方面存在显著差异。

1. 环保性：水性漆烤漆房使用水基涂料替代有机溶剂，因此具有更低的毒性和挥发性。这使得工作环境更为安全和健康，减少对操作人员的危害。而普通烤漆房则可能释放有害气体，如苯等有害物质，需要采取去甲醛等措施。
2. 涂层质量：水性漆烤漆房所使用的水基涂料能够在短时间内快速干燥，形成均匀平滑的漆膜，保持被喷涂物体的原貌，提高涂层的附着力和耐久性。而普通烤漆房中的有机溶剂涂料可能需要更长时间干燥，且干燥过程中可能出现漆膜不均匀、有颗粒等缺陷。
3. 喷涂效果：水性漆具有较高的流变性，喷涂过程中能够更好地贴合物体的表面，形成更为平滑、光滑的涂层。而普通烤漆房中的有机溶剂涂料流变性较低，喷涂效果可能不如水性漆烤漆房。
4. 安全性和设施要求：水性漆烤漆房的安全等级可能稍低一些，同时由于其性能与温度、湿度直接相关，因此除了常规的温度加热装置外，还需要考虑降温设备和湿度控制设施，以确保最佳的喷涂效果。

综上所述，水性漆烤漆房在环保性、涂层质量、喷涂效果以及设施要求等方面均优于普通烤漆房。随着社会对环保要求的提高，水性漆烤漆房有望成为未来烤漆行业的主流趋势。